PubMed-søgning: guide til MeSH, blokke og filtre (og AI på dansk)

Findes der et PubMed på dansk?

PubMed, databasen fra US National Library of Medicine, er helt på engelsk: brugerflade, abstracts og indeksering. En søgning skrevet på dansk giver få relevante hits. Der er to veje: lær at bygge en systematisk søgning med MeSH og blokke (denne guide), eller stil spørgsmålet på dansk til et værktøj, der gør det for dig (sidst i guiden).

Trin 1: del spørgsmålet op i blokke

En god PubMed-søgning starter med et klart spørgsmål. Brug PICO til at dele det op:

• Population: hvem handler det om?
• Intervention: hvilken behandling eller eksponering?
• Comparison: hvad sammenlignes med? (ofte udeladt i søgningen)
• Outcome: hvilket effektmål?

Hvert begreb bliver én blok. Spørgsmålet "Reducerer SGLT2-hæmmere indlæggelser hos patienter med hjertesvigt?" giver tre blokke: hjertesvigt, SGLT2-hæmmere og indlæggelse.

Trin 2: find MeSH-termer til hver blok

MeSH (Medical Subject Headings) er det kontrollerede ordforråd, som hver artikel i MEDLINE indekseres med. Søger du på en MeSH-term, finder du alle artikler om emnet, uanset hvilke ord forfatterne har brugt.

• Åbn MeSH Database i PubMed og skriv det engelske ord. Du ser den foretrukne term, definitionen, underemner (therapy, diagnosis, drug therapy og andre) og mere specifikke termer.
• Find et studie, der rammer præcis dit emne, og se, hvilke MeSH-termer det er indekseret med.
• Dit universitets- eller hospitalsbibliotek har ofte vejledninger og kan hjælpe med større søgninger.

Trin 3: tilføj fritekst i titel og abstract

De nyeste artikler er ofte endnu ikke indekseret med MeSH. Derfor supplerer du hver blok med fritekst:

Feltkode	Hvad den gør	Eksempel
[Mesh]	Søger MeSH-termen og dens mere specifikke termer	"Heart Failure"[Mesh]
[Majr]	Afgrænser til artikler, hvor termen er et hovedemne	"Heart Failure"[Majr]
[Mesh:NoExp]	Søger termen uden de mere specifikke termer	"Heart Failure"[Mesh:NoExp]
[tiab]	Ordet i titel eller abstract	"heart failure"[tiab]
[pt]	Publikationstype	"Randomized Controlled Trial"[pt]
[la]	Publikationssprog	danish[la]

• Trunkering: stjernen erstatter slutningen af et ord. hospitali*[tiab] finder hospitalization, hospitalisation og hospitalized. Brug mindst fire bogstaver før stjernen.
• Frase: sæt anførselstegn, "heart failure"[tiab], så PubMed ikke deler udtrykket op.
• Bemærk: trunkering og anførselstegn slår PubMeds automatiske termmatchning (Automatic Term Mapping) fra. Kombiner derfor altid MeSH-termen og fritekst i samme blok.

Trin 4: kombiner blokkene

Inden for en blok kombinerer du synonymer med OR. Blokkene kombinerer du med AND. Operatorerne skrives med store bogstaver, og parenteser styrer rækkefølgen.

("Heart Failure"[Mesh] OR "heart failure"[tiab] OR "cardiac failure"[tiab])
AND
("Sodium-Glucose Transporter 2 Inhibitors"[Mesh] OR empagliflozin[tiab] OR dapagliflozin[tiab] OR "SGLT2 inhibit*"[tiab])
AND
("Hospitalization"[Mesh] OR hospitali*[tiab])

Du kan også bygge blokkene én ad gangen og kombinere dem under Advanced i PubMeds søgehistorik, for eksempel #1 AND #2 AND #3.

Trin 5: brug filtre

I venstre side af resultatlisten kan du afgrænse på:

• Article type: for eksempel Randomized Controlled Trial, Meta-Analysis eller Systematic Review.
• Publication date: de seneste 1, 5 eller 10 år, eller et selvvalgt interval.
• Language: for eksempel engelsk og dansk.
• Text availability: kun artikler med gratis fuldtekst.

Filtre er praktiske, men vær forsigtig i en systematisk søgning: filtre bygger på indeksering, og nye artikler kan falde udenfor.

Trin 6: gem søgningen og dokumentér den

• Opret en gratis My NCBI-konto og gem søgningen. Du kan få besked på e-mail, når nye artikler matcher.
• Notér søgestrengen, datoen og antallet af hits. Det gør søgningen reproducerbar, som i et systematisk review.
• Åbn hvert udvalgt studie og tjek design, population og dato, og se efter mærket Retracted Publication.

Eller: stil spørgsmålet på dansk og få svar med PMID

At bygge en søgning tager tid. Med Wysor skriver du spørgsmålet på dansk, som til en kollega. Wysor oversætter det til MeSH-termer og fritekst, bygger den booleske logik, søger i PubMed (omkring 40 millioner referencer) og omkring 10 millioner fuldtekster fra Europe PMC og svarer på dansk. Hvert udsagn henviser til sin artikel med PMID, så du kan åbne referencen og tjekke den. Tilbagetrukne studier markeres, og du kan filtrere på studietype, dato, tidsskrift og sprog.

Wysor hostes i EU, har nul datalagring hos modeludbyderne og træner ikke modeller på dine data. Det hjælper dig med at finde og forstå evidensen, uden at stille diagnoser. Læs også medicinsk AI for danske læger og OpenEvidence i Danmark og alternativer.